农业昆虫与害虫防治学科始建于中国人民解放军农牧大学时期，1995年开始与沈阳农业大学联合招收硕士研究生， 2006年获得硕士学科授权点和农业推广硕士授权点。该学科具有功能完备、设备配套和先进的实验室。在科学研究方面，本学科注重理论联系实际，立足吉林，面向全国，逐步形成了“昆虫与植物互作的机制研究”、“害虫生物防治 ”和“生物安全评价” 三个稳定的研究方向。同时加强与国内国际科研单位、大学的联系，并建立了良好的合作关系，提高自身的科研水平。本学科以解决当前农业生产中的害虫问题为重点，围绕国家生物安全等研究重点，积极参与科研工作，目前承担国家科技攻关项目（分题主持）、“十一五”国家科技支撑计划——蔬菜大豆重大病虫害防控技术项目（分题主持）、吉林省科技厅资助项目、长春市国际合作等科研项目5项。重视教学研究工作，承担吉林省级精品课程 “普通昆虫学”等教学改革课题2项。近五年来，该方向在核心期刊上发表相关研究论文20余篇，其中SCI论文2篇，获吉林省教育技术成果奖1项，出版专著1部，获得国家实用发明专利1项。