吉林大学研究生院建于1984年6月，是经国务院批准的全国22所重点大学首批试办的研究生院之一。1996年3月，经原国家教委批准又成为首批正式建院的研究生院之一。

　　吉林大学研究生教育起步较早，1949年开始招收研究生班，1952年开始招收三年制研究生，1978年开始培养学位研究生。

　　1985年10月，经国务院批准，吉林大学成为首批建立博士后科研流动站的单位之一。

　　根据国务院关于高教管理体制改革和布局结构调整的决定，经教育部批准，2000年6月12日，分别隶属教育部、卫生部、国土资源部、信息产业部的吉林大学、吉林工业大学、白求恩医科大学、长春科技大学、长春邮电学院5所高校合并组建新的吉林大学。2004年原解放军军需大学并入吉林大学。新组建的吉林大学，学位与研究生教育的学科门类更加齐全，覆盖了哲学、经济学、法学、文学、教育学、历史学、理学、工学、医学、农学、管理学、军事学、艺术学全部十三大学科门类。全校现有一级学科博士学位授权点44个，一级学科硕士学位授权点59个，各类专业学位授权点30个。有一级学科国家重点学科4个（覆盖17个二级学科），二级学科国家重点学科15 个，国家重点（培育）学科4个。博士后科研流动站37个。中国科学院和中国工程院院士18人（双聘9人），国务院学位委员会学科评议组成员18人，博士生导师1312人；在校博士生、硕士生2.5万余人。副校长、博士生导师吴振武教授兼任研究生院院长，赵丁选教授任常务副院长，刘娅教授、田文晶教授任副院长；下设学位办公室、研究生培养处、研究生管理处、研究生综合处。