妇产科、眼科、皮肤科、基本外科及耳鼻喉科是吉林省、吉林大学重点临床科室；心血管外科完成的世界首例冠状动脉右室瘘的瘘口修补加右冠状动脉成形术和国内首例双极射频消融改良MazeⅣ手术治疗房颤的病例，均达到了世界先进水平，在吉林省内完成首例本省医生主刀的心脏移植手术：一期完成主动脉瓣和二尖瓣膜置换，三尖瓣膜成形，心房血栓清除，冠状动脉搭桥及双极射频治疗房颤的复杂手术治疗。在吉林省内率先独立开展冠脉搭桥手术，包括常规体外循环下冠脉搭桥术，非体外循环心脏跳动下冠脉搭桥术等等。此外，呼吸内科、泌尿外科、心血管内科、胸外科、皮肤科、耳鼻喉科、脑外科等多项治疗技术水平均达到了国内领先水平，为吉林省医疗水平的发展做出突出贡献。

　　改革开放以来，多次接收日本、美国、加拿大、韩国等研究人员来院学习中医、针灸技术，并不断向美国、日本、韩国、俄罗斯、奥地利、澳大利亚等国家派出专业人员研修、考察，同时邀请了一些国外学者来院讲学、访问，并聘请名誉教授、顾问等多人，并与韩国延世大学Severance医院结为友好医院，加强了学术交流和友好往来。
　　1993年9月医院通过了卫生部检查团的检查验收，为吉林省内综合医院首家国家级爱婴医院，1994年4月又进入卫生部三级甲等医院行列。2004年在中华医学会举办的“让患者明明白白看病，争创百姓放心医院”活动中被评为首批“全国百姓放心示范医院”。多年来，多次荣获国家及省市校各级荣誉称号百余项，2008年被中国卫生思想政治工作促进会评为全国卫生系统思想政治工作先进单位穿越岁月的长河，历经六十余年的洗礼。吉林大学第二医院凝心聚力，秉承优良传统，以科学发展观为统领，以高质量的医疗水平和良好的医德医风努力服务社会、服务人民。站在新的起点，吉林大学第二医院将用手中绚丽的画笔在未来发展蓝图上书写更加华美的篇章！