贵州大学博士研究生入学考试大纲

考试科目代码及名称：2036生物医学信息学基础   

一、考试基本要求  

本科目考试着重考核考生掌握生物医学信息学基本概念、基本思想、基本分析方法和基本理论的程度，要求考生对生物医学信息学理论体系的基本框架有一个比较全面的了解，并能综合运用所学的生物医学信息学的基本原理、高级程序语言、检测技术等知识分析生物医学信息学相关基本问题。 

二、适用范围

适用于医学信息工程专业 

三、考试形式

     闭卷，180分钟

四、考试内容和考试要求

1． 核酸基础

考试内容：

DNA和RNA的结构，中心法则，翻译过程，基因的结构和基因的调控，进化的突变与核苷酸序列的关系。

考试要求：

（1）理解DNA和RNA的结构，掌握四种不同类型的碱基组成，以及双螺旋结构的形成、碱基的排列方式，了解常见的RNA分子碱基配对结构；

（2）理解“中心法则”的内涵，掌握翻译过程；

（3）掌握真核生物和原核生物基因的结构，及相同点和不同点，了解基因调控蛋白质的作用机制；

（4）理解进化的突变与核苷酸序列的关系。

2．蛋白质的结构

考试内容：

蛋白质多级结构概念及特点，二级结构的构成，常见几种不同类型的折叠结构及物理机制，氨基酸倾向于形成特定结构方式及种类，同源蛋白质的概念，蛋白质折叠的稳定状态

考试要求：

（1）掌握蛋白质多级结构，了解多级结构的特点；

（2）理解二级结构的构成方式，掌握常见几种不同类型的折叠结构及物理机制；

（3）理解不同结构的蛋白质对生物信息学的启发，掌握氨基酸倾向于形成特定结构方式及种类；

（4）了解同源蛋白质的基本概念，蛋白质折叠的稳定状态的物理基础。

3．数据库的处理

考试内容：

正确理解数据库是生物信息学研究的基础，目前存在的常见数据库类型，存在不同类型数据库的原因，平面文件如何成为第一种类型的数据库，数据质量的重要性，检查数据库和人类医疗的关系

考试要求：

（1）理解数据库与生物信息学之间的关系，了解生物信息学中常见数据类型；

（2）了解存在不同类型数据库的原因，了解平面文件如何成为第一种类型的数据库；

（3）理解数据质量在生物信息学中的重要性，理解检查数据库和人类医疗的关系。

4.序列联配

考试内容：

序列联配的原理，FASTA格式的短片段数据搜索方法，BLAST的基本思想和方法，模式和蛋白质功能的关系

考试要求：

（1）理解序列联配的原理，掌握FASTA格式的短片段数据搜索方法，以及BLAST的基本思想和方法；

（2）理解模式和蛋白质功能的关系。

5.基因组特征

考试内容：

原核基因预测的特点，鉴定剪切位点的方法，检测tRNA的方法，鉴别蛋白质编码区域

考试要求：

（1）了解原核基因预测的特点，掌握鉴定剪切位点的方法

（2）了解检测tRNA的方法，掌握鉴别蛋白质编码区域的方法。

6.统计方法在二级结构预测中的应用

考试内容：

确定蛋白质二级结构的几种方法，跨膜蛋白结构的预测，找到结合位点的原则和方法。

考试要求：

了解蛋白质二级结构的几种方法，理解跨膜蛋白结构的预测的方法，掌握通过带电荷表面和疏水表面法判断结合位点。